1997年4月，原广西大学和原广西农业大学合并成立新广西大学，新广西大学将原两校的审计部门合并成立了新的广西大学审计处；2001年1月，审计处与纪委办公室、监察室合署办公；2014年5月至今，审计处恢复独立。
目前，审计处下设办公室、财经审计科、基建审计科、修缮审计科、综合审计科等5个，现有职工11人。
广西大学审计处是在校长直接领导下，负责学校内部审计工作的正处级职能部门，业务上接受区教育厅、审计厅等上级部门的指导和监督。审计处的主要职责是依照国家法律、法规、政策以及学校的有关规定，对学校及所属单位的财政财务收支情况及有关经济活动的真实性、合法性、效益性、适当性、有效性进行审查、确认、评价、咨询，旨在促进学校完善治理、防范风险、创造效益、增加价值和实现目标。
根据学校及部门职责要求，列入审计处主要审计事项有：财务预算编制执行及决算、财务收支及有关经济活动、内部控制、干部任期经济责任、科研经费、各种专项资金、基建及修缮工程项目建设全过程、大宗物品及设备采购、固定资产的使用和管理等等。
